Mendelian Randomization

token申请

软件安装

• 安装软件到非系统盘
我用夸克网盘分享了「subMRSetup.exe」，点击链接即可保存。打开「夸克APP」，无需下载在线播放视频，畅享原画5倍速，支持电视投屏。 链接：https://pan.quark.cn/s/d33159ea3fa1

• 下载安装包，双击安装！一定记住这个软件安装路径，后面要用！

软件更新

• 下载最新exe文件，替换安装目录下对应的exe文件！
我用夸克网盘分享了「subMR.exe」，点击链接即可保存。打开「夸克APP」，无需下载在线播放视频，畅享原画5倍速，支持电视投屏。 链接：https://pan.quark.cn/s/511ec7244677

软件激活【使用过程中切记不可翻墙】

• 填入QQ号、手机号，然后点击一键复制

• 添加管理微信，将一键复制内容发给管理员

• 将管理员发的卡密填入

• 【可选】勾选自动登录和记住密码！

软件使用

• 将该压缩包解压到工作路径下

• 工作路径文件夹【1kg.v3和plinkbinr两个文件夹放在工作路径下面】

• 软件中设置好下面各个参数！

• R安装路径可以支持任意位置自行安装的环境

• R安装路径同时支持软件安装目录下的R环境【强烈建议】

• 【目前我有近2K个R包，先放进来几百个，后面会陆续放进来】

版本更新示意图

GWAS数据要求

• 目前格式自动支持【官网下载的标准格式即可】：其中vcf需要先转化成csv

• vcf等其他格式需要先转化成csv，再放入暴露或结局文件夹内！
• .csv
• .csv.gz
• .txt
• .txt.gz
• .tsv
• .tsv.gz
• .vcf
• .vcf.gz

• 可能个别数据没有snp和samplesize记得先自行补充再计算！

• 需要具有的列数据：MR常用分析基础学习一下！

• 下面列举的名称可以不一致，只要是常见的形式即可，如snp可以是rsid等
• snp
• chr
• pos
• effect_allele
• other_allele
• beta
• se
• pval
• z
• eaf
• samplesize
• or
• ncase
• ncontrol